Casó con Leonor de Aragón, hija de Pedro IV el Cermonioso, en Soria (1375). De esta unión nacieron:

- Enrique el Doliente (1379 - 1406), rey de Castilla con el nombre de Enrique III y;
- Fernando el de Antequera (1380 - 1416), rey de Aragón con el nombre de Fernando I.

Muerta Leonor, se volvió a casar con Beatriz de Portugal, heredera del trono de Portugal. De esta unión nació:

- Miguel (¿? - ¿?), muerto en la niñez.

Al fallecer sin herederos varones Fernando I de Portugal, padre de su esposa Beatriz, Juan I optó a dicha corona, quedando Pedro González, su ayo, como uno de los regentes de Castilla en 1384.

Al año siguiente, 1385, Juan va a la guerra contra Juan de Avis hijo bastardo del rey Pedro I de Portugal y por tanto hermanastro de Fernando I, guerra que acabó en la desastrosa derrota de Aljubarrota, donde, tras la desbandada de las tropas castellanas, consiguió salvar la vida gracias a su ayo, que falleció.

Enrique II, había recibido la ayuda de caballeros franceses dirigidos por el propio Bertrand Du Guesclin durante su enfrentamiento con Pedro I el Cruel ó el Justiciero. La victoria final de Enrique en la Guerra Civil Castellana brindará a Francia un poderoso aliado en el plano naval. Tanto Enrique como su hijo Juan, envían la Armada castellana, que destruye la escuadra inglesa en La Rochelle (1372) y saquea numerosos puertos ingleses (Rye, Rotingdean, Lewes, Folkestone, Plymouth, Portsmouth, Wight, Hastings) entre 1377 y 1380, año en que el almirante castellano Fernando Sánchez de Tovar llega incluso a amenazar Londres. Sir Ricardo Knolles en 1360 y el duque de Lancaster, Juan de Gante, en 1363 formaron cuerpos expedicionarios que atacaron el continente, pero fueron detenidos.

Mantuvo la amistad con Carlos III de Navarra, casado con su hermana Leonor, poniendo fin a los conflictos entre ambos reinos.

Al subir al trono, nombró a su ayo Pedro González de Mendoza, señor de Hita y de Buitrago, como Mayordomo Mayor, y al poco Capitán General de sus ejércitos. En 1383 le nombró señor de la mitad del Real de Manzanares (Madrid).

En 1389 donó la villa de Aguilar de Campos, (Valladolid) que hasta entonces había pertenecido a los Almirantes de Castilla, a Don Alfonso Enríquez.

Fundó el monasterio cartujo del Monasterio del Paular, junto al nacimiento del río Lozoya, en Madrid.

Murió a consecuencia de la caída de un caballo que le habían regalado, al parecer durante una demostración hípica en Alcalá de Henares, ocultada su muerte por el Cardenal Tenorio durante varios días, alegando que estaba herido. Hasta arreglar todo lo relacionado con la regencia. Está enterrado en la Capilla de Reyes Nuevos de Toledo.